La basilica fu eretta nella prima metta del IV secolo con il nome di Basilica Apostolorum, e ascritta agli apostoli Pietro e Paolo, perchè secondo la tradizione sorgeva sulle catacombe dove sono custoditi i corpi dei due martiri.
Verso il 350, quando le relique del santo soldato Sebastiano furono trasferite qui, il nome della chiesa e delle catacombe venne cambiato.Fu ricostruita nel 1613, e l'interno, ad unica grande naveta, presenta un bel soffitto ligneo con la raffigurazione di Sen Sebastiano.Le catacombe si sviluppano su 4 piani; interessante l'ambiente detto Triclia, dove si svolgevano macabri banchetti funebri.